Pivoňky mají málo škůdců, ale nemocíovlivňující listoví, stonky, květiny a pupeny, mnoho. Nejčastěji jsou přivedeni na místo spolu s rostlinným materiálem. Pro včasné zastavení vývoje choroby pivoňky je nutné je pravidelně přezkoumávat za deštivého počasí. Pokud je to nutné, postříkejte rostlinu fungicidy. Z času na čas jsou pivoňky přesazeny na nové místo po rozdělení keře na polovinu. Pokud dodržujete všechna bezpečnostní opatření, nevzniknou žádné problémy s barvami. Pokud se však na listech a pupenech objevily první příznaky bakteriální nebo plísňové infekce, je nejlepší vědět, která nemoc ovlivnila rostlinu a jak se s ní vypořádat.
Nejběžnější a možná i škodlivýnemoc pivoňky je šedá hniloba. Ovlivňuje nejen pupeny, stonky a listy, ale také podzemní kořenovou část. Nejčastěji mladé výhonky na jaře trpí touto plísní nemocí během období opětovného růstu. První známkou poškození rostliny je vzhled na dně stonku šedého plaku. Na tomto místě se pak vytvoří tmavé skvrny. Rostlina je velmi křehká, stonky jsou často ohnuté a padají na zem. Šedá hniloba se vyvíjí zvláště aktivně v deštivém, chladném a vlhkém prameni. Patogen této fytoinfekce zimuje přes zbytky rostlin. Toto onemocnění způsobuje během vegetačního období značné škody.
Dalším onemocněním pivoňky je padlí.Je to také infekce plísňového původu. Postiženou oblastí jsou listy. Na nich se vytvoří plak, pod kterým listnatá tkáň nejprve zžloutne a pak zemře. Aby se zbavila rostlina této patogenní houby, postříká se jí mýdlovou sloučeninou. Roztok se skládá z 20 g síranu měďnatého, 150 - 200 g zeleného mýdla a 10 litrů vody.