Анализа крижања је крижањехибридни узорак са узорком анализатора. Као анализатор одабран је хомозиготни појединац код кога се рецесивна особина огледа у фенотипу. Аналитички крстови се широко користе у узгоју и генетици за одређивање генотипа.
Као што знате, према законима генетике, рецесивнокод монохибридног крижања, особина се не појављује у првој генерацији. У другој генерацији појављује се само код једне шеснаест особа. Рецесивна особина сачувана је у генотипу јединки прве генерације, али се у њима не појављује споља. Дакле, појединац прве генерације који има рецесивну карактеристику у генотипу не разликује се у фенотипу од монохибридне јединке у доминантној особини. Анализа крижања има за циљ добијање информација о присуству или одсуству рецесивне особине у генотипу.
Размотримо механизам за одређивање генотипа јединкесиве мухе. Сива боја је доминантна карактеристика у односу на црну боју тела инсекта. Биолог прелази сиве мухе са црним и процењује настало потомство. Ако све јединке имају сиву боју, тада је проучена муха имала само доминантну особину у генотипу. Ако половина мува добије црну боју, онда можемо закључити да постоји рецесивна особина.
Са непотпуном доминацијом сваког генотипаодговара његовом фенотипу. Да бисте открили да ли је нека особина опажена код појединца последица непотпуне доминације или независне особине својствене генетици, такође је неопходно извршити анализу укрштања. Ако је испитивана особина резултат непотпуне доминације, тада ће доћи до њеног даљег „мешања“ са рецесивном карактеристиком анализатора. Ако је особина независна, пренеће се непромењено свим појединцима, ако је проучавани појединац хомозигот, или део јединки, ако је хетерозиготан. На пример, ако се крижање ружичастог и белог цвећа показало светло ружичастим, онда овде постоји непотпуна доминација. Ако сви хибриди првог реда имају ружичасто цвеће, онда је ова особина уграђена у алел као независна и доминира над белим. У овом случају, испитни појединац је хомозиготни. Ако су неки хибриди наследили ружичасту боју латица, а други део је пренесен у белу, онда је ружичаста особина независна, доминантна, испитивана индивидуа носи обе особине у генотипу.
У пракси, за одређивање генотипа није увекдовољно је направити анализу прелаза. Пример који спада у категорију изузетака може се објаснити једним од три начина нелелних интеракција гена: епистаза, полимеризација или комплементарност.
У епистази, експресија гена једног алелапар је споља способан генима другог алелног пара. Супресори могу да носе и доминантне и рецесивне особине. Као резултат епистазе, код крижања хомозиготне јединке са црвеним цвећем (доминантна особина) и хомозиготне јединке са белим цвећем (рецесивна особина), у првој генерацији хибрида биће само биљке са црвеним цвећем, а у другој - 3/4 хибрида ће имати црвену боју, 3 / 16 је бела, а 1/16 ће наследити особину другог алела (на пример, жуто).
Да би се објаснио ефекат појаве полимеризације, може седајте следећи пример. Цветови садрже неколико хетерозиготних алела који носе црвене (доминантне) и беле (рецесивне) боје латица. Што су рецесијнији хибриди друге генерације, бели је цвет. Ако појединац има алеле са и без доминантне особине, нешто између тих особина појављује се споља. При одређивању генотипа анализом крстова, полимеризација се лако меша са непотпуном доминацијом.
Комплементарношћу, неалелни гени се надопуњују и доприносе формирању нове особине.