Головний мозок - основний регулятор всіх функціональних відправлень організму, а також його поведінкових актів, які спрямовані на адаптацію до зовнішніх умов життя.
Довгастий мозок є продовженням спинногомозку. Він має сіра речовина, що знаходиться зовні, і біла речовина, розташоване всередині. Скупчення клітинних тіл нейронів утворюють в довгастому мозку ядра. Довгастий мозок - життєво важливий орган. При його ураженні відбувається порушення рефлекторних соматичних і вегетативних актів, а при руйнуванні його настає смерть. Довгастий мозок виконує провідникову і рефлекторну функції. Головний мозок регулює такі рефлекси: серцевої діяльності, тонусу судин, дихання, кашлю, чхання, слиновиділення, ковтання, шлункової і підшлункової секреції, блювоти, обміну речовин, сльозовиділення, миготіння і закриття повік, тонічних рефлексів скелетних м'язів.
З діяльністю центрів довгастого мозкупов'язане прояв настановних рефлексів пози. Рефлексами пози називаються такі рефлекси, які викликають перерозподіл тонусу м'язів кінцівок при зміні положення голови.
Головний мозок і мозочок пов'язаний аферентних і еферентних волокнами з усіма відділами ЦНС, а через них з м'язами і багатьма рецепторами організму, а також з вегетативною нервовою системою.
До основних функцій мозочка відносять:1) регуляція рухових актів; 2) регуляція вегетативних процесів. Ці функції мозочка були встановлені в дослідах із застосуванням методик екстирпації, роздратування, реєстрації біострумів мозочка, клінічних спостережень.
Мозочок добре розвинений у птахів і має великезначення для високорозвиненого у них почуття рівноваги. У перший період після видалення мозочка птах не може літати і ходити. При спробі до руху з'являються судоми, і птах падає на бік. Однак вона може приймати корм і пити. Через деякий час стан поліпшується і птиця здатна, хоча і з труднощами, стояти, ходити і літати. Науковими дослідженнями було встановлено, що в мозочку розташовані центри, що регулюють діяльність вегетативної нервової системи.
Головний мозок птахів (середній мозок) добре розвинений і складається з двох частин: двухолмия і ніжок. Двухолміе має передні і задні частки і утворено ядрами чутливих нейронів.
Основні функції середнього мозку: 1.Передня частина двухолмия є первинним зоровим центром. Тут відбувається первинний аналіз світових подразнень. За допомогою цих центрів здійснюється орієнтовна реакція на світлове подразнення (поворот голови в бік світлового подразника). Центри передньої частини двухолмия регулюють звуження зіниці. 2. Задня частина двухолмия здійснює орієнтовну реакцію на звукові подразнення (поворот голови в бік звукового подразника). 3. Чорна субстанція бере участь в регуляції скорочень скелетних м'язів. Вона також регулює акт ковтання і ритм дихання. 4. Головний мозок, а точніше середній мозок має центри настановних випрямних рефлексів. Випрямними рефлексами називаються рефлекси, які відновлюють нормальне положення тіла після його порушення.
Головний мозок плазунів на відміну від головного мозку птахів, має слабо розвинені півкулі мозку.
Проміжний мозок складається з таламуса,епіталямуса і гіпоталамуса. Проміжний мозок виконує різноманітні функції. 1. Таламус є колектором, який збирає імпульси від усіх рецепторів організму (зорових, слухових, смакових, тактильних, температурних, больових, пропріорецепторов) і направляє їх до великих півкуль. 2. У ядрах таламуса аферентні імпульси піддаються початкового аналізу і синтезу. 3. У таламусі аферентні імпульси набувають емоційне забарвлення. Там виникає почуття болю, відчуття приємного і неприємного. 4. Таламус регулює пластичний м'язовий тонус, завдяки якому птахи можуть приймати і зберігати різні пози. 5. У епіталямуса знаходяться центри, що регулюють діяльність нюхового аналізатора. 6. У гіпоталамусі локалізуються центри, що регулюють розширення зіниці, кров'яний тиск, дихання, моторну і секреторну функції шлунково-кишкового тракту. 7. Гіпоталамус регулює температуру тіла.