Друге покоління ЕОМ представляло собою перехід на транзисторную елементну базу і ознаменувало виникнення перших міні-ЕОМ.
Відбувається подальший розвиток принципу автономії- його реалізація здійснюється вже окремими пристроями, що відбивається в їх модульній структурі. Пристрої введення-виведення оснащуються своїми УУ, які називаються контролерами, завдяки чому стало можливим звільнення центрального УУ від маніпуляцій операціями по введенню-висновку.
У ЕОМ другого покоління на зміну електроннимлампам приходять транзистори, а також впроваджується використання магнітних сердечників і барабанів в ролі пристроїв пам'яті, які є далекими предками сьогоднішніх жорстких дисків. За рахунок усіх цих інновацій різко зменшилися розміри, а також вартість комп'ютерів.
Дано початок розробці на основі бібліотекстандартних додатків інтегрованих систем, які мають властивість функціонування на комп'ютерах різних марок. Найпопулярніші програмні продукти виділяють в ППП для того, щоб вирішити завдання конкретного класу.
Метою розробки системного програмногозабезпечення було спрощення і прискорення перемикання процесора між завданнями. Виникли перші системи пакетної обробки, автоматизувати запуск однієї програми за іншим, що збільшили коефіцієнт завантаження процесора. Системи пакетної обробки стали прообразом нинішніх операційних систем, вони з'явилися першими системними додатками, які призначені для управління обчислювальними процесами.